مرحوم حاج‌سیداحمد خمینی از قول امام خمینی (ره) نقل می‌کند که در مسیر مدرسه فیضیه متوجه بحث‌های گسترده درباره کتاب «اسرار هزارساله» شد. این موضوع باعث شد امام تصمیم بگیرند درس‌های اخلاق را رها کنند و به مدت حدود یک ماه تا چهل روز تمام وقت خود را صرف نگارش کتاب «کشف الاسرار» کنند، که پاسخی به کتاب «اسرار هزارساله» حکمی‌زاده بود. این کتاب در سال ۱۳۳۲ نوشته شد و امام خواستند نامشان در پشت آن ذکر نشود تا کتاب به عنوان پاسخ رسمی حوزه‌های علمیه شناخته شود. برای مدتی طولانی، نویسنده واقعی این اثر ناشناخته باقی ماند.
منبع فیش
کتاب زشتی‌ها و زیبایی‌های کربلا، سیدمحمدحسین راجی، چاپ اول، صفحه38
ماجرای تالیف کتاب کشف الاسرار
مرحوم حاج‌سیداحمد خمینی، از قول پدر بزرگوارشان امام‌خمینی(ره)دربارهٔ تدوین کتاب کشف الاسرار می‌گویند: «در حال رفتن به مدرسۀ فیضیه بودم که مشاهده کردم عده‌ای دارند راجع‌به کتاب اسرار هزارساله بحث می‌کنند. ناگهان به ذهنم آمد ما داریم درس اخلاق می‌گوییم و حال آنکه این بحث‌ها در حوزه‌ها، نفوذ کرده است».
امام، از همانجا تصمیم می‌گیرند که به مدرسۀ فیضیه برگردند و از آن زمان دیگر به درس نرفتند. در طول مدتی حدود یک ماه الی چهل روز، همۀ کارهای خود را کنار گذاشتند و کتاب کشف الاسرار را در پاسخ به کتاب اسرار هزارسالۀ حکمی زاده نوشتند. این کتاب در سال ۱۳۳۲ نوشته شد. امام فرمودند که نام ایشان در پشت کتاب نوشته نشود؛ بلکه به‌عنوان پاسخ حوزۀ علمیه این کتاب منتشر شود. تا مدت زیادی کسی نمی‌دانست نویسندۀ این کتاب کیست؟[۱]
